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We review the identified citrullinated peptide epitopes that are proposed as disease markers, specifically recognized in certain human autoimmune disorders, and discuss the diagnostic features and potential therapeutic value of anti-citrullinated protein antibodies based on ongoing clinical trials.
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BetaCitrullination or deimination is the conversion of the amino acid arginine in a protein into the amino acid citrulline. Citrulline is not one of the 20 standard amino acids encoded by DNA in the genetic code. Instead, it is the result of a post-translational modification.
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BetaWe identified 14,056 citrullination sites within 4,008 proteins and quantified their regulation upon inhibition of the citrullinating enzyme PADI4. With this resource, we provide quantitative and...
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BetaCitrullination is a post-translational modification (PTM) of great interest, characterized by the conversion of an arginine residue to a citrulline residue.
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BetaWe review the citrullinated peptide epitopes that are proposed as disease markers, specifically recognized in certain human autoimmune disorders. The potential autopathogenic role of citrullinated epitopes is also discussed. 1. Introduction. Proteins are encoded by a surprisingly limited number of genes in our genome.
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BetaCitrullination is the conversion of the amino acid arginine in a protein into the amino acid citrulline. This process is catalysed by enzymes called peptidyl arginine deiminase (PAD) and arginine deiminases (ADIs). PADs replace the primary ketimine group (>C=NH) with a ketone group (>C=O).
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BetaCitrullination is one of these modifications, where an arginine amino acid is converted to a citrulline amino acid. ... utilizing the inability of trypsin to cleave after citrullinated amino acids. Journal of Proteomics & Bioinformatics. 2013;6(12):288–295. doi: 10.4172/jpb.1000293.
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BetaTo demonstrate the utility of the method, we biochemically characterize the effect of incorporating Cit at two known autocitrullination sites in Protein Arginine Deiminase 4 (PAD4, R372 and R374)...
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BetaBased on our findings, we present a strategy for verifying citrullinated sites in complex samples post processing, in proteomics shotgun experiments. By requiring a missed cleavage for the identification of citrullinated peptides, we demonstrate that 64% of false-positively annotated citrullination sites could be removed.
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BetaIn this study, we optimized the mass spectrometry (MS) driven identification of the PTM citrullination. Citrullinated proteins and auto-antibodies against these have been associated with several diseases including: rheumatoid arthritis (RA), Alzheimer’s disease, and cancer [6 - 8].
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Citrullination or deimination is the conversion of the amino acid arginine in a protein into the amino acid citrulline. Citrulline is not one of the 20 standard amino acids encoded by DNA in the genetic code. Instead, it is the result of a post-translational modification.
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